BLCAP

Pridruženi protein kancera mokraćne bešike je protein koji je kod ljudi kodiran genom BLCAP.

Funkcija

BLCAP je identificiran postupkom diferencijane ekspresije, biopsijamama tumora dobivenim iz neinvazivnog i invazivnog karcinoma tranzicijskih ćelija bešike. Iako pretrage baze podataka nisu otkrile homologiju nijednog ljudskog gena u fazi identifikacije, od tada su identificirani ortolozi miša, pacovaa i zebrice. Čini se da je protein reguliran nizvodno tokom napredovanja karcinoma mokraćne bešike.

Protein poznat i kao BC10 protein dug je 87 aminokiselina, ali njegove biološke funkcije su uglavnom nepoznate. Međutim, uvriježeno je mišljenje da je uključen u suzbijanje tumora, smanjenjem rasta ćelijam, pokretanjem apoptoze. Široko je eksprimirani protein, ali ekspresija je posebno visoka u mozgu i limfocitima B. Alternativni promotori i alternativna prerada omogućavaju da protein postoji kao nekoliko različitih varijanti transkripta. Ovaj broj se dalje povećava jer je pre-iRNK ovog proteina podložna nekoliko prerada RNK.

Struktura Predviđa se da je struktura proteina globulasti protein sa dva transmembranska (TM) domena.

Editiranje RNK Ljudski gen BLCAP sastoji se od dva egzona koja su odvojena intronom. Egzon 1 ovog gena kodira 5′ sekvencu 5′ UTR, dok egzon 2 uključuje preostalu sekvencu 5′UTR, regiju kodiranja i 3′UTR. Kodirajuća sekvenca gena BLCAP je stoga bez introna.

Tip

Editiranje RNK od A do I katalizira porodica enzima adenozin-deaminaza, koja djeluje na RNK (ADAR) koji specifično prepoznaju adenozine u dvolančanim regijama pre-iRNK i deaminiraju ih u inozin. Inozini su u ćelijskim translacijskim mehanizmima prepoznati kao gvanozini. Postoje tri člana ADAR porodice ADAR 1-3, s tim da su ADAR 1 i ADAR 2 jedini enzimski aktivni članovi. Smatra se da ADAR3 ima regulatornu ulogu u mozgu. ADAR1 i ADAR 2 su široko izraženi u tkivima, dok je ADAR 3 ograničen na mozak. Dvolančana područja RNK nastaju uparivanjem baza između ostataka u blizini područja mjesta uređivanja sa ostacima, obično u susjednom intronu, ali mogu biti i egzonska sekvenca. Regija koja se spaja s regijom za editiranje poznata je kao komplementarna sekvenca editiranja (ECS).

Lokacija Sva mjesta za editiraranje koncentrirana su zajedno između posljednjih 150 nukleotida introna 1 i početka egzona 2. Ukupno ima 17 identificiranih mjesta za uređivanje u pre-iRNK ovog proteina. Od toga se 11 nalazi unutar intronske sekvence (1-11), tri se nalaze u 5'UTR regiji (5a, 5b, 5c), dok se tri nalaze u kodirajućoj sekvenci (Y / C lokacija, Q / R lokacija, K / R sajtova). Neka od ovih mjesta za editovanje javljaju se u visoko konzerviranom amino terminalu proteina.

Y / C etitirajhuće mjesto nalazi se na aminokiselini 2 konačnog proteina. Promjena kodona uvodi tirozin (UAU) u supstituciju (UGU) cisteinom.

Q/R mjesto je drugo kodirajuće područje koje se nalazi u aminokiselini 5 konačnog proteina. Ovdje se glutaminski (Q) kodon, pretvara u argininski (R).

Treće K / R mjesto za uređivanje unutar kodirajuće sekvence nalazi se na položaju aminokiselina 15 završnog proteina, gdje se lizin pretvara u arginin.

Predviđa se da se ECS može naći u intronu sa formiranom dvolančanom strukturom koja sadrži svih 17 mjesta za editiranje. Vjerovatno je da se sva mjesta nalaze unutar područja dupleksa da se editiranje događa istovremeno u egzonskim i intronskim sekvencama. Postoji visok nivo konzerviranosati posljednjih 150 nukleotida intronske regije i početks egzona 2.

Q / R mjesto je drugo kodirajuće područje koje se nalazi u aminokiselini 5 konačnog proteina. Ovdje je glutamin (Q_) kodon, pretvara se u arginin (R).

Treće K / R mjesto za uređivanje unutar kodirajuće sekvence nalazi se na položaju aminokiselina 15 završnog proteina gdje se lizin pretvara u arginin.

Predviđa se da se ECS može naći u intronu sa formiranom dvolančanom strukturom koja sadrži svih 17 mjesta za uređivanje. Vjerovatno je da se sve web stranice za uređivanje nalaze u dupleksnom području da se uređivanje događa istovremeno u egzoničnim i introničnim sekvencama. Postoji visok nivo očuvanja posljednjih 150 nukleotida intronske regije i početak egzona 2.

Regulacija

BLCAP protein se eksprimira u širokom spektru tkiva, ne samo u onim povezanim sa nervnim sistemom. To ukazuje na to da editovanje može uključivati enzim ADAR 1.ref name = "pmid18430892"/> Međutim, pokazalo se da ADAR1 i ADAR2 sarađuju u editiranju BLCAP transkripta. Pre-iRNK ovog proteina editira se u mnogim tkivima (srce, mokraćni mjehur, limfociti, fibroblasti, epitelne stanice i mozak), ali učestalost varira u različitim tkivima. Postoji općenito smanjenje nivoa editiranja BLCAP u astrocitomu, raku nokraćne bešike i raaku debelog crijeva u poređenju sa relevantnim normalnim tkivima. HEK 293t ćelije transficirane bilo EGFP-ADAR1, EGFP-ADAR2 ili netransficiranim HEK293 ćelijama korištene su za određivanje koji ADAR enzim je uključen u editiranje na određenim mjestima u 5'UTR i kodnom području. Razina editiranja na mjestu Y / C iznosila je 16%, dok je u moždanim ćelijama u prosjeku iznosila 21%. Pokazalo se da ADAR1 ne editira ćelije u 5 'UTR, već ADAR2 editira ćelije 5b i 5, a Y / c obje i editira Q / R i K / R mjdesta na višim nivoima od ADAR1. Nizak nivo editiranja otkriven je i u netransficiranim vektorima. Ovi rezultati pokazuju da ADAR1 i ADAR2 mogu editirati sve lokacije, pri čemu je ADAR2 efikasniji na većini mjesta.

Efekti Editiranje na Q / R i K / R mjestima rezultira pozitivnim napunjenjem aminokiselina u konzervirani amino terminal proteina. Tri moguća sajta za editiranje u kodirajućoj sekvenci mogu rezultirati prevođenjem do osam različitih izoformi proteina. Moguće promjene funkcije proteina uzrokovane ovim preziuređivanjem još uvijek su nepoznate.

Reference

Dopunska literatura

External links

Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Geni na hromosomu 20