FAST kinazni domen-sadržavajući protein 5 (FASTKD5) je protein koji je kod ljudi kodiran genom FASTKD5 sa hromosoma 20.UniProt:
Ovaj protein je dio porodice FASTKD, koja je poznata po tome što regulira energetsku ravnotežu mitohondrija pod stresom. FASTKD5 je također potreban i granulama RNK za obradu prekursorskih iRNK, koje nisu uz bok tRNK.
Struktura
FASTKD5 dijeli strukturne karakteristike porodice FASTKD, uključujući amino terminalni domen za ciljanje mitohondrija i tri domena C-kraja: dva FAST domena slična kinazi (FAST_1 i FAST_2) i domen koji veže RNK (RAP). Domen ciljanja mitohondrija usmjerava FASTKD5 na unos u mitohondrije. Iako su funkcije C-krajevih domena nepoznate, RAP vjerovatno veže RNK tpkom trans-prerade. Ovaj protein tvori proteinski kompleks od 103 kDa s neidentificiranim proteinima.
Aminokiselinska sekvenca MAATLKSLKLVRYRAFCSPSAFGAVRSVSYWNVSSTQHGGQDPPEHISLC HSAKKVKNICSTFSSRRILTTSSAHPGLEFSKTSSSKASTLQLGSPRATG VDEEDVEVFDSFENMRVFLQLRPEYRVHSYNASETSQLLSVSEGELILHK VRVNQNNLQAQVIVDYLCKLSSLPAEQHPVLLGSTSFALLCQLSVKKIQL FDTQDLINVLKAFVILGIPHSHSMLDVYETKCCHQVWEMNMDQLLLVADL WRYLGRKVPRFLNIFSSYLNLHWKDLSLSQLVHLIYVIGENRQVSQDLMQ KLESLILKYIDLINLEEVGTICLGFFKSSTNLSEFVMRKIGDLACANIQH LSSRSLVNIVKMFRFTHVDHINFMKQIGEIAPQRIPSLGVQGVMHLTLYC SALRFLNEGVMNAVAASLPPRVAHCRSKDVAKILWSFGTLNYKPPNAEEF YSSLISEIHRKMPEFNQYPEHLPTCLLGLAFLEYFPVELIDFALSPGFVR LAQERTKFDLLKELYTLDGTVGIECPDYRGNRLSTHLQQEGSELLWYLAE KDMNSKPEFLETVFLLETMLGGPQYVKHHMILPHTRSSDLEVQLDVNLKP LPFNREATPAENVAKLRLEHVGVSLTDDLMNKLLKGKARGHFQGKTESEP GQQPMELENKAAVPLGGFLCNVADKSGAMEMAGLCPAACMQTPRMKLAVQ FTNRNQYCYGSRDLLGLHNMKRRQLARLGYRVVELSYWEWLPLLKRTRLE KLAFLHEKVFTSAL </table> O: Alanin C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin P: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin Protein kodiran ovim genom po funkciji pripada fosfoproteinima. Uključen u takve biološke procese kao prerada iRNK i acetilacija.
Protein ima mjesto za vezanje za RNK, rRNK. Lokalizirano u mitohondrijama i njihovim nukleoidima.
Funkcija Kao član porodice FASTKD, FASTKD5 se lokalizuje u mitohondrijama radi modulacije njihove energetske ravnoteže, posebno u uvjetima stresa. Iako se posvuda eksprimira u svim tkivima, FASTKD5 se obilnije pojavljuje u skeletnim mišićima, srčanom mišiću i drugim tkivima bogatim mitohondrijama. FASTKD5 se također lokalizira u granulama RNK, bez membranskih tijela koja sadrže iRNK i pridruženim proteiniima koji vežu RNK, gdje olakšava posttranskripcijsku obradu RNK. Ovaj protein potreban je za sazrijevanje prekursorskih iRNK, koje nisu flankirane putem tRNK, pa se stoga ne mogu obraditi kanonskim putem sazrijevanja iRNK.
Klinički značaj Iako veza s FASTKD5 ostaje neokarakterizirana, nakupljanje abnormalnih granula RNK može dovesti do nekih neurodegenerativnih bolesti.
Interakcije Pokazano je da FASTKD5 ima interakcije sa: FASTKD2, DHX30, i GRSF1.
Reference
Kategorija:Neokarakterizirani proteini Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Geni na hromosomu 20