Spermatogenezi-pridruženi protein 2 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SPATA2. Kloniranje i ekspresija Sekvenciranjem klonova dobijenih iz frakcionirane biblioteke cDNK mozga, Nagase et al. (1998) klonirali su SPATA2, koji su označili KIAA0757. Izvedeni protein sadrži 520 aminokiselina. RT-PCR ELISA otkrila je nisku do umjerenu ekspresiju u svim testiranim tkivima, uključujući testise. Graziotto et al. (1999) izolirali su fragment SPATA2, koji su označili kao PD1, i pojačali su cDNK pune dužine, pomoću 5-obazne RACE biblioteke cDNK testisa. Izvedeni protein s 520 aminokiselina ima izračunatu molekulsku masu od 58,4 kD i dijeli oko 33% identiteta sa RBM, proteinom koji veže RNK i koji je uključen u spermatogenezu. SPATA2 je visoko hidrofilni. Nema signalni peptid, bogat je serinom i sadrži 17 ostataka cisteina koji se pretežno nalaze u C-terminalnom domenu. SPATA2 također ima nekoliko potencijalnih mjesta fosforilacije, ali nema mjesta N-glikozilacije.
Northern blot analizom otkriven je obilni prijepis od 2,7 kb i rjeđa trankripcija od 4,0 kb, s najvećom ekspresijom u testisima. Slabija ekspresija otkrivena je u slezeni, zatim timusu i prostati. SPATA2 normalno nije otkriven u leukocitima maternice, tankog i debelog crijeva ili periferne krvi. Western blot analizom ekstrakata ćelija testisa, otkriven je protein s prividnom molekulskm masom od 60 kD, kao i manje obilan protein od 46 do 48 kD. Ekspresija oba proteina, posebno manjeg , smanjena je u nekoliko testikulopatija. Imunohistohemijska analiza otkrila je SPATA2 u citoplazmi Sertolijevih ćelija. SPATA2 nije otkriven u spermatogenim ćelijama i Leydigovim ćelijama, a jedra su bila negativna u svim tipovima ćelija.Graziotto, R., Foresta, C., Scannapieco, P., Zeilante, P., Russo, A., Negro, A., Salmaso, R., Onisto, M. cDNA cloning and characterization of PD1: a novel human testicular protein with different expressions in various testiculopathies. Exp. Res. Commun. 248: 620-626, 1999.Nagase, T., Ishikawa, K., Suyama, M., Kikuno, R., Miyajima, N., Tanaka, A., Kotani, H., Nomura, N., Ohara, O. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XI. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 5: 277-286, 1998. [PubMed]: 9872452
Aminokiselinska sekvenca Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
1020304050 MGKPSSMDTKFKDDLFRKYVQFHESKVDTTTSRQRPGSDECLRVAASTLL SLHKVDPFYRFRLIQFYEVVESSLRSLSSSSLRALHGAFSMLETVGINLF LYPWKKEFRSIKTYTGPFVYYVKSTLLEEDIRAILSCMGYTPELGTAYKL RELVETLQVKMVSFELFLAKVECEQMLEIHSQVKDKGYSELDIVSERKSS AEDVRGCSDALRRRAEGREHLTASMSRVALQKSASERAAKDYYKPRVTKP SRSVDAYDSYWESRKPPLKASLSLRKEPVATDVGDDLKDEIIRPSPSLLT MASSPHGSPDVLPPASPSNGPALLRGTYFSTQDDVDLYTDSEPRATYRRQ DALRPDVWLLRNDAHSLYHKRSPPAKESALSKCQSCGLSCSSSLCQRCDS LLTCPPASKPSAFPSKASTHDSLAHGASLREKYPGQTQGLDRLPHLHSKS KPSTTPTSRCGFCNRPGATNTCTQCSKVSCDACLSAYHYDPCYKKSELHK FMPNNQLNYKSTQLSHLVYR
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Geni na hromosomu 20