KATNBL1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom KATNBL1.
Katanini su ATPaze za razlaganje mikrotubula, a sastoje se od katalitskih i regulatornih podjedinica, koje reguliraju dužinu mitotskog vretena. Predviđa se da će KATNBL1 funkcionirati kao regulatorna podjedinica katanina (Roll-Mecak i McNally, 2010). Patricia Hartz (2015) mapirala je gen KATNBL1 u hromosom 15q14, na osnovu poravnanja sekvence KATNBL1 (GenBank AK026210) sa genomskom sekvencom (GRCh38).Hartz, P. A. Personal Communication. Baltimore, Md. 2/19/2015.
Kloniranje i ekspresija Analizom baze podataka, Roll-Mecak i McNally (2010) identificirali su C15ORF29 kao vjerovatnu regulatornu podjedinicu katanina. Međutim, za razliku od kanonske regulatorne podjedinice p80 katanina KATNB1, C15ORF29 nema N-terminalni WD40 domen i ima samo konzerviranu C-terminalni domen.Roll-Mecak, A., McNally, F. J. Microtubule-severing enzymes. Curr. Opin. Cell Biol. 22: 96-103, 2010. PubMed: 19963362 Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 304 aminokiseline, a molekulska težina 34.767 Da.. 1020304050 MASETHNVKKRNFCNKIEDHFIDLPRKKISNFTNKNMKEVKKSPKQLAAY INRTVGQTVKSPDKLRKVIYRRKKVHHPFPNPCYRKKQSPGSGGCDMANK ENELACAGHLPEKLHHDSRTYLVNSSDSGSSQTESPSSKYSGFFSEVSQD HETMAQVLFSRNMRLNVALTFWRKRSISELVAYLLRIEDLGVVVDCLPVL TNCLQEEKQYISLGCCVDLLPLVKSLLKSKFEEYVIVGLNWLQAVIKRWW SELSSKTEIINDGNIQILKQQLSGLWEQENHLTLVPGYTGNIAKDVDAYL LQLH Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Funkcija gena Koristeći ljudske proteine eksprimirane u E. coli, McNally i McNally (2011) otkrili su da je C15ORF29 vezao stabilizirane mikrotubule in vitro. Dodavanjem katalitske kataninske podjedinice KATNAL1 povećan je afinitet vezanja mikrotubula iznad onog koji se mjeri za bilo koji protein. Analiza mutacije otkrila je da je C15ORF29 vezao KATNAL1 preko N-terminalnog domena.McNally, K. P., McNally, F. J. The spindle assembly function of Caenorhabditis elegans katanin does not require microtubule-severing activity. Molec. Biol. Cell 22: 1550-1560, 2011. Note: Erratum: Molec. Biol. Cell 23: 4472 only, 2012. PubMed: 21372175
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Kategorija:Geni na hromosomu 15 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika