Hromodomenskohelikazni DNK-vezujući protein 7, poznat i kao ATP-ovisna helikaza CHD7 je enzim koji je kod ljudi kodiran genom CHD7. Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je čak 2.977 aminokiselina, а molekulska težina 335.927 Da.
1020304050 MADPGMMSLFGEDGNIFSEGLEGLGECGYPENPVNPMGQQMPIDQGFASL QPSLHHPSTNQNQTKLTHFDHYNQYEQQKMHLMDQPNRMMSNTPGNGLAS PHSQYHTPPVPQVPHGGSGGGQMGVYPGMQNERHGQSFVDSSSMWGPRAV QVPDQIRAPYQQQQPQPQPPQPAPSGPPAQGHPQHMQQMGSYMARGDFSM QQHGQPQQRMSQFSQGQEGLNQGNPFIATSGPGHLSHVPQQSPSMAPSLR HSVQQFHHHPSTALHGESVAHSPRFSPNPPQQGAVRPQTLNFSSRSQTVP SPTINNSGQYSRYPYSNLNQGLVNNTGMNQNLGLTNNTPMNQSVPRYPNA VGFPSNSGQGLMHQQPIHPSGSLNQMNTQTMHPSQPQGTYASPPPMSPMK AMSNPAGTPPPQVRPGSAGIPMEVGSYPNMPHPQPSHQPPGAMGIGQRNM GPRNMQQSRPFIGMSSAPRELTGHMRPNGCPGVGLGDPQAIQERLIPGQQ HPGQQPSFQQLPTCPPLQPHPGLHHQSSPPHPHHQPWAQLHPSPQNTPQK VPVHQHSPSEPFLEKPVPDMTQVSGPNAQLVKSDDYLPSIEQQPQQKKKK KKNNHIVAEDPSKGFGKDDFPGGVDNQELNRNSLDGSQEEKKKKKRSKAK KDPKEPKEPKEKKEPKEPKTPKAPKIPKEPKEKKAKTATPKPKSSKKSSN KKPDSEASALKKKVNKGKTEGSENSDLDKTPPPSPPPEEDEDPGVQKRRS SRQVKRKRYTEDLEFKISDEEADDADAAGRDSPSNTSQSEQQESVDAEGP VVEKIMSSRSVKKQKESGEEVEIEEFYVKYKNFSYLHCQWASIEDLEKDK RIQQKIKRFKAKQGQNKFLSEIEDELFNPDYVEVDRIMDFARSTDDRGEP VTHYLVKWCSLPYEDSTWERRQDIDQAKIEEFEKLMSREPETERVERPPA DDWKKSESSREYKNNNKLREYQLEGVNWLLFNWYNMRNCILADEMGLGKT IQSITFLYEIYLKGIHGPFLVIAPLSTIPNWEREFRTWTELNVVVYHGSQ ASRRTIQLYEMYFKDPQGRVIKGSYKFHAIITTFEMILTDCPELRNIPWR CVVIDEAHRLKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHF LEPSRFPSETTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAP KEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFTFLSKGGGQANVPNLLNTMMELRK CCNHPYLINGAEEKILEEFKETHNAESPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLP KLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYPYERIDGRVRGNLRQAAID RFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARC HRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRENATN GVQQLSKKEIEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTHTITI ESEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNN LVIDTPRVRKQTRLYSAVKEDELMEFSDLESDSEEKPCAKPRRPQDKSQG YARSECFRVEKNLLVYGWGRWTDILSHGRYKRQLTEQDVETICRTILVYC LNHYKGDENIKSFIWDLITPTADGQTRALVNHSGLSAPVPRGRKGKKVKA QSTQPVVQDADWLASCNPDALFQEDSYKKHLKHHCNKVLLRVRMLYYLRQ EVIGDQADKILEGADSSEADVWIPEPFHAEVPADWWDKEADKSLLIGVFK HGYEKYNSMRADPALCFLERVGMPDAKAIAAEQRGTDMLADGGDGGEFDR EDEDPEYKPTRTPFKDEIDEFANSPSEDKEESMEIHATGKHSESNAELGQ LYWPNTSTLTTRLRRLITAYQRSYKRQQMRQEALMKTDRRRRRPREEVRA LEAEREAIISEKRQKWTRREEADFYRVVSTFGVIFDPVKQQFDWNQFRAF ARLDKKSDESLEKYFSCFVAMCRRVCRMPVKPDDEPPDLSSIIEPITEER ASRTLYRIELLRKIREQVLHHPQLGERLKLCQPSLDLPEWWECGRHDRDL LVGAAKHGVSRTDYHILNDPELSFLDAHKNFAQNRGAGNTSSLNPLAVGF VQTPPVISSAHIQDERVLEQAEGKVEEPENPAAKEKCEGKEEEEETDGSG KESKQECEAEASSVKNELKGVEVGADTGSKSISEKGSEEDEEEKLEDDDK SEESSQPEAGAVSRGKNFDEESNASMSTARDETRDGFYMEDGDPSVAQLL HERTFAFSFWPKDRVMINRLDNICEAVLKGKWPVNRRQMFDFQGLIPGYT PTTVDSPLQKRSFAELSMVGQASISGSEDITTSPQLSKEDALNLSVPRQR RRRRRKIEIEAERAAKRRNLMEMVAQLRESQVVSENGQEKVVDLSKASRE ATSSTSNFSSLSSKFILPNVSTPVSDAFKTQMELLQAGLSRTPTRHLLNG SLVDGEPPMKRRRGRRKNVEGLDLLFMSHKRTSLSAEDAEVTKAFEEDIE TPPTRNIPSPGQLDPDTRIPVINLEDGTRLVGEDAPKNKDLVEWLKLHPT YTVDMPSYVPKNADVLFSSFQKPKQKRHRCRNPNKLDINTLTGEERVPVV NKRNGKKMGGAMAPPMKDLPRWLEENPEFAVAPDWTDIVKQSGFVPESMF DRLLTGPVVRGEGASRRGRRPKSEIARAAAAAAAVASTSGINPLLVNSLF AGMDLTSLQNLQNLQSLQLAGLMGFPPGLATAATAGGDAKNPAAVLPLML PGMAGLPNVFGLGGLLNNPLSAATGNTTTASSQGEPEDSTSKGEEKGNEN EDENKDSEKSTDAVSAADSANGSVGAATAPAGLPSNPLAFNPFLLSTMAP GLFYPSMFLPPGLGGLTLPGFPALAGLQNAVGSSEEKAADKAEGGPFKDG ETLEGSDAEESLDKTAESSLLEDEIAQGEELDSLDGGDEIENNENDE
Funkcija CHD7 je ovisan o ATP-u remodelator hromatina homologan proteinu Drosophila grupa tritoraksni kismet. Mutacije u CHD7 povezane su sa sindromom CHARGE. Ovaj protein pripada većoj grupi kompleksa za remodeliranje hromatina ovisnih o ATP-u, potporodica CHD.
Modelni organizmi + Fenotip nokaut-miša Chd7 Svojstvo FenotipVijabilnost homozigota Nenormalan Studija letalne recesivnosti Nenormalan Plodnost Normalan Tjelesna težina Normalan Anksioznost otvorenog polja Normalan Neurološka procjenaNenormalanSnaga stiskaNormalan Test vruće ploče Normalan Dismorfologija Normalan Indirektna kalorimetrija Normalan Test tolerancije glukoze Normalan Slušni odgovor moždanog stabla Normalan DEXA Normalan Radiografija Normalan Tjelesna temperatura Normalan Morfologija oka Nenormalan Klinička hemija Normalan Hematologija Normalan Limfociti periferne krviNormalan Mikronukleus test Normalan Težina srca NormalanHistopatologija mozga Nenormalan Salmonella infekcija Normalan Citrobacter infekcija Normalan Svi testovi i analize su premaMouse Resources Portal, Wellcome Trust Sanger Institute. U studiji finkcije CHD7 upotrebljeni su i modelni organizmi. Uslovna linija nokaut-miševa, zvana Chd7tm2a (EUCOMM) Wtsi generirana je kao dio progtama Međunarodnog konzorcija za nokaut-miševe — visokopropusnog projekta mutageneze za generiranje i distribuciju životinjskih modela bolesti zainteresiranim naučnicima.
thumb|left|Histološki presjek Bergmeisterove papile
Mužjaci i ženke podvrgnuti su standardiziranom fenotipskom pregledu, kako bi se utvrdili efekti delecija. Na mutantnim miševima izvedena su 24 ispitivanja i uočeno je pet značajnih abnormalnosti. Nijedan homozigotni mutantni embrion nije identificiran tokom gestacije, pa stoga nijedan nije preživio do odbijanja. Preostali testovi provedeni su na heterozigotnim mutantnim odraslim miševima. Muški heterozigoti pokazali su abnormalnu elevaciju karlica u modificiranom SHIRPA testu i imaju visoku učestalost Bergmeisterove papile na oba oka. Prilikom proučavanja mozga heterozigotnih životinjprimijećeno je odsustvo corpus callosum.
Klinički značaj
Mutacije u ovom genu povezane su sa sindromom CHARGE.
Reference
Dopunska literatura
In In In
Vanjski linkovi
Kategorija:Mišji mutirani geni Kategorija:Geni na hromosomu 8 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika