Glutamatom bogati protein 5 je protein koji je kod ljudi kodiran genom 'ERICH5, znan i kao otvoreni okvir čitanja 47 hromosoma 8 (C8orf47). Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 374 aminokiseline, а molekulska težina 39.936 Da.
1020304050 MGCSSSALNKAGDSSRFPSVTSNEHFSTAEESESCFAQPKPHALGRESTV DGNVQRESRPPLQKLKVSAEPTANGVKPLQEQPLAKDVAPGRDATDQSGS TEKTQPGEGLEESGPPQPGGKEDAPAAEGKKKDAGAGTEAESLKGNAEAQ PLGPEAKGQPLQAAVEKDSLRAVEVTENPQTAAEMKPLGTTENVLTLQIA GELQPQGTVGKDEQAPLLETISKENESPEILEGSQFVETAEEQQLQATLG KEEQPQLLERIPKENVTPEVLDRSQLVEKPVMNDPFHKTPEGPGNMEQIQ PEGIVGSMEHPARNVEAGAYVEMIRNIHTNEEDQRIEGETGEKVETDMEN EKVSEGAETKEEETGEVVDLSAAT
Gen Gen ERICH5 se nalazi na ljudskom hromosomu 8 na 8q22.2 i prostire se na 29 kb na plus lancu DNK. ERICH5 ima tri egzona i dva introna. ERICH5 je takođe poznat kao C8orf47 i glutamatom bogati protein 5.
Protein
Izoforme Protein ERICH5 ima dvije izoforme. Najduža izoforma 1 obuhvata 1.550 parova baza i sastavljen je od 374 aminokiseline. Drugoj izoformi nedostaje treći i posljednji egzon, a dugačak je 596 parova baza.
Domeni i motivi ERICH5 sadrži jedan konzervirani domen, domen nepoznate funkcije koji se naziva DUF4573. Predviđa se da ERICH5 sadrži dva visoko očuvana motiva, kompleks koji promovira anafazu (APC/C) vezujući motiv i motiv LIG_FHA_2. Motiv APC/C obuhvata aminokiselina 222-226 i služi kao mjesto vezanja za kompleks koji promovira anafazu. Motiv LIG_FHA_2 uključen je u put kontrolne ćelijske tačke i nalazi se u mnogim proteinima u jedru koji regulira ćelijski ciklus.
Posttranslacijske modifikacije Predviđa se da će ERICH5 proći kroz nekoliko posttranslacijskih modifikacija, uključujući fosforilaciju, O-vezanu glikozilaciju i sumolizaciju. Mnoga mjesta fosforilacije i mjesta O-glikozilacije predviđena su na istoj aminokiselini. Prikazane posttranslacijske modifikacije su one konzervirane među ERICH5 ortolozima. Predviđeno je da nekoliko kinaza fosforilira ERICH5, uključujući PKC, cdc2, CKI, PKA, DNk PK, ATM, EGFR i CKII. Posttranslacijska modifikacijaLokacija aminokiselina Fosforilacija S4, S5, S27, S32, S49, T50, S58, S100, T101, T104, T138, S169, S227, S234, T239,T248, S274, T289, S307,Y320, T340, T346O-GlikozilacijaS5,S27, S32, S49, T50, S58, S100, T101, T104, T138, S169, S227, S234, T239, T248, S274, T289,S307SumoilacijaK121, K131, K211, K251, ,K343, K360
Sekundarna struktura Predviđeno je da ERICH5 sadrži tri alfa-helikss i dva beta-lista, kao i područja nasumične zavojnice. thumb|Sekundarna struktura ERICH5 thumb|Interakcije proteina ERICH5
Subćelijska lokalizacija Predviđeno je da je ERICH5 lokaliziran u jedru.
Interakcije proteina Predviđeno je da ERICH5 stupa u interakciju s nekoliko proteina preko dvohibridnog skrininga kvasca i afinitetne hromatografije. Predviđeno je da je nekoliko proteina s kojima je ERICH5 stupio u interakciju također lokalizirano u jedru.
Ekspresija thumb|280px|Normalna ekspresija gena ERICH5 i raznim tkivima
Normalna ekspresija ERICH5 pokazuje povišene nivoe ekspresije u fetusnoj jetri, jetri odraslih, gušterači i mrežnjači u poređenju sa drugim tkivima.
Ekspresija u bolesti thumb|280px|Ekspresija ERICH5 kod alkoholnog hepatitisa. ERICH5 pokazuje povećanu ekspresiju u alkoholnom hepatitisu.
Homologija
Paralozi Ne postoje poznati paralozi ERICH5.
Ortolozi Pravi ortolozi ERICH5 identificirani su samo među vrstama sisara. Najdalji srodni ortolog sisara je Monodelphis domestica'' (sivi kratkorepi oposum). Rod i vrstaUobičajeno imeDivergencija od ljudi (milioni godina)Sličnost IdentitetPristupni brojDužina proteina Acinonyx jubatus Gepard9671%65%XP_014937513.1358CerathotheriumBijeli nosorog9671%66%XP_004431343.2358Trichechus manatus latirostris Morska krava10568%59%XP_004370879.3342MonodelphisSivi kratkorepi oposum15940%28%XP_007488209.1478
Udaljeni ortolozi ERICH5 ima udaljene ortologe među pticama i gmizavcima. Ovi udaljeni ortolozi sadrže samo treći egzon ERICH5-a. Rod i vrstaUobičajeno imeDivergencija od ljudi (milioni godina)Sličnost IdentitetPristupni brojDužina proteina Gallus gallusKokoš31280%64%XP_004940017.1207Chysemys picta belliPjegava kornjača31274%59%XP_008166572.1442
Reference
Kategorija:Geni na hromosomu 8 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika