Egzoribonukleaza

thumb|Dijagrami reakcije i za hidrolitsku (lijevo) i za osforolitsku (desno) 3'-5' egzoribonukleaznu degradaciju RNK Egzoribonukleaza je vanjedarna ribonukleaza, enzim koji razgrađuje RNK uklanjanjem terminalnih nukleotida s bilo kojeg 5 'kraja ili 3'kraja molekula RNK. Enzimi koji uklanjaju nukleotide sa 5 'kraja nazivaju se 5'-3' egzoribonukleaze , a oni koji uklanjaju nukleotide sa 3' kraja nazivaju se 3'-5' egzoribonukleaze.

Egzoribonukleaze za cijepanje veze mogu koristiti ili vodu nukleotid-nukleotida (hidrolitska aktivnost) ili neorganski fosfat (što senaziva fosforolizna aktivnost). Hidrolitske egzoribonukleaze razvrstane su pod EC broj 3.1, a fosforolitske eksoribonukleaze pod EC broj 2.7.7. Kako fosforolitski enzimi za cijepanje veza koriste anorganski fosfat, oni oslobađaju nukleotid-difosfate, dok hidrolitski enzimi (koji koriste vodu) oslobađaju nukleotid-monosfosfate.

Egzoribonukleaze postoje u svim carstvima života: bakterijama, arhejama i eukariotima. Egzoribonukleaze su uključene u razgradnju mnogih različitih tipova RNK, uključujući iRNK, tRNK, rRNK i miRNK. Egzoribonukleaze mogu biti pojedinačni proteini (kao što je Rnaza D ili RNaza PH), ali mogu biti i kompleksi više proteina, kao što je egzosomski kompleks (u kojem su četiri glavne porodice egzoribonukleaza ).

Glavne porodice PorodicaPrimjer članaDistribucijaKatalitska aktivnost RNR RNaza RVećina bakterija, svi eukarioti 3'-5' hidrolizaRNaza IIRrp44 DEDD Rnaza D Određene bakterije, svi eukarioti 3'-5' hidrolizaRNaza TPM/Scl-100Oligoribonukleaza RBN RNaza BN Određene bakterije 3'-5' hidroliza PDX PNPaza Sva carstva 3'-5' FosforilizaPM/Scl-75Rnaza PH RRP4 Rrp4 Svi eukarioti, većina arheja 3'-5' Hidroliza 5PX Egzoribonukleaza I Svi eukarioti 5'-3' HidrolizaEgzoribonukleaza II

Također pogledajte Endoribonukleaza Nukleaza Dezoksiribonukleaza Egzodezoksiribonukleaza Endodezoksiribonukleaza

Reference

Vanjski linkovi

Kategorija:Ribonukleaze Kategorija:Biomolekule