Kaspaza-6 jest enzim koji je kod ljudi kodiran genom CASP6 sa hromosoma 4. Ortolozi CASP6 identificirani su kod brojnih sisara za koje su dostupni potpuni podaci o genomu. Jedinstveni ortolozi su također prisutni kod ptica, gušterova, Lissamphibia, i teleostea. Kaspaza-6 ima poznate funkcije u apoptozi, ranom imunskom odgovoru i neurodegeneracijama u Hantingtonovoj i Alzheimerovoj bolesti.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 293 aminokiseline, a molekulska težina 33.310 Da.
1020304050 MSSASGLRRGHPAGGEENMTETDAFYKREMFDPAEKYKMDHRRRGIALIF NHERFFWHLTLPERRGTCADRDNLTRRFSDLGFEVKCFNDLKAEELLLKI HEVSTVSHADADCFVCVFLSHGEGNHIYAYDAKIEIQTLTGLFKGDKCHS LVGKPKIFIIQACRGNQHDVPVIPLDVVDNQTEKLDTNITEVDAASVYTL PAGADFLMCYSVAEGYYSHRETVNGSWYIQDLCEMLGKYGSSLEFTELLT LVNRKVSQRRVDFCKDPSAIGKKQVPCFASMLTKKLHFFPKSN
Funkcija Ovaj gen kodira protein koji je član porodice cistein-aspartatnih proteaza (kaspaza). Sekvencna aktivacija kaspaza ima centralnu ulogu u fazi izvršenja ćelijskih apoptoza. Kaspaze postoje kao neaktivni proenzimi koji se podvrgavaju proteolitskoj obrada na konzerviranim asparaginskim ostacima kako bi se dobile dvije podjedinice, velika i mala, koje se dimer pretvaraju u aktivni enzim. Ovaj protein se obrađuje kaspazama 7, 8 i 10, i smatra se da funkcioniše kao nizvodni enzim u kaskadi aktivacije kaspaze. Kaspaza-6 se također može podvrgnuti samoobradi bez drugih članova porodice kaspaza. Alternativna prerada RNK ovog gena rezultira dvije varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme.
Kaspaza-6 ima ulogu u ranom imunskom odgovoru putem derepresije. Smanjuje ekspresiju imunosupresivnog citokina interleukina-10 i cijepa makrofage potiskujući IRAK-M.
Što se tiče neurodegeneracija, kaspaza-6 cijepa HTT u Huntingtonovoj i APP u Alzheimerovoj bolesti. U oba slučaja rezultira agregacijom proteinskih fragmenata.
Interakcije
Pokazalo se da kaspaza 6 reaguje sa kaspazom-8.
Također pogledajte Proteolizna mapa Kaspaza
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi The MEROPS online database for peptidases and their inhibitors: C14.005
Kategorija:EC 3.4.22 Kategorija:Kaspaze Kategorija:Geni na hromosomu 4 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika