thumb|upright=1.7| Biljni mikrobiom sastoji se od različitih mikrobnih zajednica na vanjskoj površini i u unutrašnjim tkivima biljke domaćina. Zajednice rizosfera i filosfera nalaze se na vanjskoj strani biljke, dok se zajednica endosfere nalazi unutar nje. Material was copied from this source, which is available under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Neki mikroorganizmi, poput endofita, prodiru i zauzimaju unutrašnja tkiva biljaka, formirajući endosferski mikrobiom. Arbuskularna mikoriza i druge endofitske gljive su dominantni kolonizatori endosfere. Bakterije, a do određene mjere Archaea, su važni članovi endosfernih zajednica. Neki od ovih endofitskih mikroba stupaju u interakciju sa svojim domaćinom i pružaju očigledne koristi biljkama. Za razliku od rizosfere i rizoplana, endosfere sadrže vrlo specifične mikrobne zajednice. Endofitska zajednica korijena može se vrlo razlikovati od zajednice susjednog tla. Općenito, raznolikost endofitske zajednice je niža od raznolikosti mikrobne zajednice izvan biljke. Identitet i raznolikost endofitskog mikrobioma nadzemnih i podzemnih tkiva također se mogu razlikovati unutar biljke.
Lišće i bakterije thumb|upright=1.8|
Izloženost svjetlosti može pokrenuti fotosintezu u listovima biljaka, kao što su lisnato povrće, i povećati koncentracije fotosintetskih proizvoda, poput glukoze, unutar tkiva lista. Bakterije koje postoje na površinama lista mogu reagovati na dostupne fotosintetske proizvode i migrirati u tkivo lista putem hemotaksija, prema gradijentu koncentracije hranjivih tvari. Kada se bakterije nađu unutar tkiva lista, ne mogu se isprati, što predstavlja rizik za potrošače. Nekoliko bakterija, kao što su Escherichia coli i Salmonella enterica, mogu se pričvrstiti za mikrostrukturu na površini listova biljaka, kao što su trihomi, stome i žljebovi, i lokaliziraju se na mjestima koja nisu dostupna vodi za pranje i sredstvima za dezinfekciju. Bakterije se također mogu infiltrirati u dostupne otvore na površini lista, kao što su stomate, posjekotine i rane, te dosegnuti desetine mikrometara ispod lisne epidermie. Ova infiltracija može predstavljati rizik za ljudsku konzumaciju sirovog lisnatog povrća.
Svjetlost je jedna od pokretačkih sila koje mogu podstaknuti infiltraciju patogenih bakterija u listove biljaka. Inkubacija S. enterica (serovar Typhimurium) na listovima ledene salate na svjetlu dovela je do povezivanja bakterija u blizini otvorenih stoma i infiltracije u tkivo lista. Međutim, tamni uslovi uzrokovali su raspršeni obrazac pričvršćivanja na površini lista i slabu infiltraciju stoma. Hranjive tvari, poput glukoze i saharoze, koje proizvode fotosintetski aktivne ćelije u tkivu lista tokom izlaganja svjetlosti, privlačne su za bakterije koje mogu biti u početku prisutne na površini lista. Otvaranje stoma na svjetlu otvara bakterijama mogućnost transporta putem hemotaksije prema gradijentima hranjivih tvari u unutrašnjost lista. Mnoge biljke su razvile mehanizme stomne odbrane kako bi zatvorile stome, nakon percepcije površinskih struktura bakterija, poznatih kao molekularni obrasci povezani s mikrobima (MAMP). Međutim, to nije uvijek uspješno i pokazalo se da neki ljudski patogeni prodiru u unutrašnjost lista putem procesa uključenog u hemotaksije i pokretljivost.
Reference
Kategorija:Mikrobiomi Kategorija:Biljke