Les « trois grands mystères des chemins de fer japonais » sont une série d'incidents criminels survenus de juillet à et non résolus encore aujourd'hui. Les principaux suspects sont des membres du syndicat des travailleurs de la compagnie ferroviaire et du parti communiste japonais.

Il s'agit de : l'accident de Shimoyama : le corps démembré du président de la compagnie ferroviaire, Sadanori Shimoyama, est retrouvé sur une voie ferrée le (la possibilité d'un simple suicide en se jetant sous un train a été écartée) ; l'accident de Mitaka : un train roulant sans personne à son bord déraille et tue six personnes le ; l'accident de Matsukawa : un train déraille car une partie de la voie ferrée a été sabotée et trois des agents à son bord meurent le .

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