bélyegkép| Közép-ázsiai kobra A ribonukleáz V1 (RNáz V1) olyan ribonukleáz enzim ami a közép-ázsiai kobra (Naja oxiana) mérgében található meg. A kettős szálú RNS-t nem szekvencia-specifikus módon hasítja, többnyire legalább hat halmozott nukleotid szubsztrátjára van szüksége. Sok ribonukleázhoz hasonlóan, ennek az enzimnek az aktivitásához is magnéziumionok jelenléte szükséges.
Laboratóriumi használat A tisztított RNáz V1 a molekuláris biológiai kísérletek során egy gyakran alkalmazott reagens. Más ribonukleázokkal együtt, amelyek az egyszálú RNS-t specifikus nukleotidok vagy szekvenciák után hasítják - például az RNáz T1 és az RNáz I -, fel lehet használni a belső kölcsönhatások megismerésére összetett másodlagos szerkezetű nagy RNS-molekulákban, vagy DNS-lábnyom-kísérleteket lehet végezni olyan makromolekuláris komplexekkel, amelyek tartalmaznak RNS-t.
Az RNáz V1 egy gyakran használt laboratóriumi RNáz, amely bizonyítékot szolgáltat a kettős szálú spirális konformációk jelenlétére a cél RNS-ben. Mivel az RNáz V1 aktív a bázispáros, de egyszálú RNS-sel szemben, az RNáz V1 és az RNáz I iránti kettős érzékenység a cél RNS molekula egyetlen helyén szolgáltat bizonyítékot az RNS hurkokban található viszonylag szokatlan konformációra. bélyegkép| A transzfer RNS jellegzetes másodlagos szerkezete kettős hélixeket tartalmaz, melyeket rugalmas hurkok választanak el.
Strukturális felfedezések Az RNáz V1 különösen fontos szerepet játszott a transzfer RNS jellegzetes szár-hurok struktúrájának magyarázatában. Széles körben alkalmazták a retrovírusok, például a hepatitis C, dengue vírus, és a HIV erősen strukturált RNS genomjainak tanulmányozására is. . Az S1 nukleázhoz hasonlóan, amely specifikusan hasítja az egyszálú RNS-t, fel lehet használni a messenger RNS molekulák másodlagos szerkezeti hajlamainak megismerésére, ez az eljárás teljes transzkriptómokra is alkalmazható, akkor ha mély szekvenálással párosulnak.
Hivatkozások
Kategória:Enzimek