A Nanobdellati (2024-ig DPANN) egy archeaország. Sok tagja a horizontális géntranszfer új jeleit mutatja más doménektől.
A Nanobdellati monofíliája még nem tekinthető megalapozottnak a benne lévő törzsek magas mutációs rátája miatt. Ezek az elemzések ehelyett arra utalnak, hogy a Nanobdellati az Euryarchaeotához tartozik, vagy polifiletikus, és különböző pozíciókat foglal el az Euryarchaeotán belül.
A Nanobdellatiba különböző elterjedésű és anyagcseréjű törzsek tartoznak, kezdve a szimbiotikus és termofil formáktól, mint például a Nanoarchaeota, az acidofilektől, mint a Parvarchaeota, és a nem extremofil fajoktól, mint az Aenigmarchaeota és a Diapherotrites. A Nanobdellati-t nitrátban gazdag talajvízben is kimutatták a víz felszínén.
Jellemzők
Fontos jellemzőjük, hogy más archaeákhoz képest kis méretűek, és a genomjuk is kicsi. Sok tagja a más organizmusokkal való parazita vagy szimbionta kapcsolattól függ. Sok jellemzőjük hasonló vagy analóg az ultra-kis baktériumokéhoz (CPR csoport).
A kis genom miatt az anyagcsere kapacitása korlátozott, így sokuknál hiányoznak a nukleotidok, aminosavak és lipidek központi bioszintetikus útvonala. Emiatt a legtöbb Nanobdellati-faj, mint például az ARMAN archaea más mikrobákra támaszkodnak biológiai szükségleteik kielégítésében. De azok, amelyekben megvan a lehetőség a szabad életre, azok fermentálók és aerob heterotrófok..
Túlnyomórészt anaerobok, és nem tenyésztették őket. Sokuk extremofil, mint például termofil, hiperacidofil, hiperhalofil vagy fém rezistens. De a tengeri és tavi üledékek mérsékelt égövi környezetében is előfordulnak. Ritkán megtalálhatók a földön vagy a nyílt óceánban.
Osztályozás
Diapherotrites. Egy USA-ban található elhagyott aranybánya talajvízszűréséből nyert genomok filogenetikai elemzésével találták meg.Genomes Online Database Parvarchaeota és Micrarchaeota. Savas bányavízben fedezték fel őket. Nagyon kis méretűek és korábban ARMAN-nak hívták őket. Woesearchaeota és Pacearchaeota. Mind az üledékekben, mind a víztartó rétegekben és tavakban azonosították őket, különösen sós körülmények között. Aenigmarchaeota Bányák szennyvizében és termálvizek üledékeiben találhatták meg. Nanohalarchaeota. Magas sótartalmú környezetekben él. Nanoarchaeota Először egy Izland partjai melletti hidrotermális forrásban fedezték fel. Más archeák szimbiontáiként élnek..
Törzsfejlődés
Tom A. Williams et al. 2017, Castelle et al. 2015 and Dombrowski et al. 2020. Jordan et al. 2017 Cavalier-Smith2020 and Feng et al 2021.Yutian Feng, Uri Neri, Sean Gosselin, Artemis S Louyakis, R Thane Papke, Uri Gophna, Johann Peter Gogarten (2021). The Evolutionary Origins of Extreme Halophilic Archaeal Lineages. Oxford Academic.Egyes filogenetikai elemzések szerint a Nanobdellati lehet az archeák elsőként divergáló kládja. Az újabb filogenetikai elemzések szerint a törzsek között a következő kapcsolatok állnak fent.Más filogenetikai elemzések szerint a Nanobdellati az Euryarchaeotához tartozhat, vagy akár polifiletikus is lehet, és különböző pozíciókat foglalhat el az Euryarchaeotán belül. Vitatott az is, hogy az Altiarchaeota törzset a Nanobdellati vagy az Euryarchaeota csoportba kell-e besorolni.Nina Dombrowski, Jun-Hoe Lee, Tom A Williams, Pierre Offre, Anja Spang (2019). Genomic diversity, lifestyles and evolutionary origins of DPANN archaea. Nature. A Nanobdellati egy alternatív elhelyezése a filogenetikai fában a következő.Jordan T. Bird, Brett J. Baker, Alexander J. Probst, Mircea Podar, Karen G. Lloyd (2017). Culture Independent Genomic Comparisons Reveal Environmental Adaptations for Altiarchaeales. Frontiers. Az idézőjelben jelölt csoportokat a Nanobdellatihoz rendelték, de a Nanobdellati csoport többi tagjától filogenetikailag elkülönülnek.
Taxonómia A jelenleg elfogadott rendszertan a List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature-ön (LPSN) és a National Center for Biotechnology Information (NCBI) adatbázisán alapul.
Superphylum "DPANN" Rinke et al. 2013 Phylum "Undinarchaeota" Dombrowski et al. 2020 Class "Undinarchaeia" Dombrowski et al. 2020 Order "Undinarchaeales" Dombrowski et al. 2020 Phylum "Huberarchaeota" Probst et al. 2019 Class "Huberarchaeia" corrig. Probst et al. 2019 Order "Huberarchaeales" Rinke et al. 2020 Phylum "Aenigmatarchaeota" corrig. Rinke et al. 2013 (DSEG, DUSEL2) Class "Aenigmatarchaeia" corrig. Rinke et al. 2020 Order "Aenigmatarchaeales" corrig. Rinke et al. 2020 Phylum "Nanohalarchaeota" corrig. Rinke et al. 2013 Class "Nanohalobiia" corrig.La Cono et al. 2020 Order "Nanohalobiales" La Cono et al. 2020 Class ?"Nanohalarchaeia" corrig. Narasingarao et al. 2012 Order "Nanohalarchaeales" Phylum Altarchaeota Probst et al. 2018 (SM1) Class "Altarchaeia" corrig. Probst et al. 2014 Order "Altarchaeales" corrig. Probst et al. 2014 Phylum "Iainarchaeota" ["Diapherotrites" Rinke et al. 2013] (DUSEL-3) Class "Iainarchaeia" Rinke et al. 2020 Order "Forterreales" Probst & Banfield 2017 Order "Iainarchaeales" Rinke et al. 2020 Phylum "Micrarchaeota" Baker & Dick 2013 Class "Micrarchaeia" Vazquez-Campos et al. 2021 Order "Anstonellales" Vazquez-Campos et al. 2021 (LFWA-IIIc) Order "Burarchaeales" Vazquez-Campos et al. 2021 (LFWA-IIIb) Order "Fermentimicrarchaeales" Kadnikov et al. 2020 Order "Gugararchaeales" Vazquez-Campos et al. 2021 (LFWA-IIIa) Order "Micrarchaeales" Vazquez-Campos et al. 2021 Order "Norongarragalinales" Vazquez-Campos et al. 2021 (LFWA-II) Phylum "Nanoarchaeota" Huber et al. 2002 Class "Nanoarchaeia" Vazquez-Campos et al. 2021 Order "Jingweiarchaeales" Rao et al. 2023 [DTBS01] Order "Nanoarchaeales" Huber et al. 2011 Order "Pacearchaeales" (DHVE-5, DUSEL-1) Order "Parvarchaeales" Rinke et al. 2020 (ARMAN 4 & 5) Order "Tiddalikarchaeales" Vazquez-Campos et al. 2021 (LFW-252_1) Order "Woesearchaeales" (DHVE-6) Phylum ?"Mamarchaeota" Order ?"Wiannamattarchaeales"
Jegyzetek
Kategória:Archeafőtörzsek