Mesochelydia (dal greco mesos ossia "medio" e chelys ossia "tartaruga") è un clade all'interno di Pantestudines, più inclusivo di Perichelydia, ma meno di Testudinata. Il clade è noto sin dal Giurassico inferiore e contiene tutti i rappresentanti giurassici di Testudinata ad eccezione di Australochelys. Si pensa che la condizione ancestrale per i Mesochelydia fosse acquatica, in contrapposizione a quella terrestre per Testudinata. I componenti di questo gruppo si distinguono dai Testudinata più basali per la presenza delle seguenti caratteristiche: cintura pettorale a cinghia, sopramarginali assenti, processo entoplastrale posteriore ridotto, undici paia di periferici, processo interfenestrale allungato, tubercoli basioccipitali appaiati, cavo del timpano e antro postotico completamente formati, vomere singolo, narici esterne confluenti, lacrimali e sopratemporali assenti.

Classificazione †Condorchelys Formazione Cañadón Asfalto, Toarciano, Argentina †Eileanchelys Formazione Kilmaluag, Bathoniano, Scozia †Heckerochelys V. B. Sukhanov. 2006. An archaic turtle, Heckerochelys romani gen. et sp. nov. from the Middle Jurassic of Moscow region, Russia. Fossil Turtle Research 1:112-118 Formazione Moskvoretskaya, Bathoniano, Russia †Indochelys Formazione Kota, Toarciano, India †Kayentachelys Formazione Kayenta, Sinemuriano, Stati Uniti Perichelydia

È noto anche un taxon mesochelidio basale non-perichelidio indeterminato proveniente dalla Formazione Batylykh del Cretaceo inferiore, in Russia.

Il seguente cladogramma segue gli studi di Tong et al. 2022:

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