Генеральний настоятель (також Головний настоятель) — настоятель, який є головою цілого чернечого ордену або конгрегації.
Термін в основному використовується як загальний термін, у той час як багато орденів та згромаджень використовують інші конкретні назви, зокрема: Генеральний абат; Генеральний кустос; Генеральний магістр; Пастир-генерал; Мати-настоятелька; Генеральний пріор; Генеральний ректор; Протоархимандрит.
У багатьох випадках існує проміжний рівень між ним і настоятелями окремих монастирів або еквівалентних громад, часто з титулом провінційного настоятеля.
Див. також Генеральний магістр ордена проповідників Генерал Товариства Ісуса Протоархимандрит Василіянського Чину