W tym samym roku otrzymał:
Nagrodę Narodowego Centrum Nauki za wybitne osiągnięcia naukowe (odkrycie mechanizmu działania głównej rybonukleazy organizmów eukariotycznych – kompleksu egzosomu oraz poznanie funkcji genu C16orf57, którego mutacje powodują poikilodermę z neutropenią)Laureaci Nagrody Narodowego Centrum Nauki w 2013 r. [dostęp 2026-02-18].. Nagrodę im. Jakuba Karola Parnasa przyznawaną przez Polskie Towarzystwo Biochemiczne za pracę naukową zatytułowaną C16orf57, a gene mutated in poikiloderma with neutropenia, encodes a putative phosphodiesterase responsible for the U6 snRNA 3' end modificationPolskie Towarzystwo Biochemiczne – Nagroda im. Jakuba Karola Parnasa [dostęp 2026-02-19].
W 2018 r. otrzymał Nagrodą FNP za wyjaśnianie funkcji kluczowych enzymów degradujących RNA, których dysfunkcja prowadzi do stanów patologicznychDziembowski, Gałęski, Pachucki i Snyder – laureatami Nagrody FNP | Nauka w Polsce [dostęp 2026-02-19]..
W 2021 r. ponownie otrzymał Nagrodę im. Jana Karola Parnasa za najlepszy polski oryginalny artykuł biochemiczny, a także Nagrodę Prezesa Rady Ministrów za wybitne osiągnięcia naukoweNagroda Prezesa Rady Ministrów dla prof. A. Dziembowskiego – IIMCB [dostęp 2026-02-18]..