Akt III Achoreusz opowiada Kleopatrze o spotkaniu Ptolemeusza z Cezarem w porcie i o wręczeniu przez króla rzymskiemu wodzowi głowy Pompejusza. Ptolemeusz ofiaruje Cezarowi tron egipski, co stanowi obelgę dla republikanina. Cezar wyrzuca Ptolemeuszowi zbrodnię na bezbronnym Ptolemeuszu. Król broni się twierdząc, że w ten sposób usłużył Cezarowi. Ten jednak nie przyjmuje takiej służby, obiecuje wszakże ochronić krew królewską, jeśli Ptolemeusz wskaże, tych którzy są winni zamordowania króla Pontu. Antoniusz przekazuje Cezarowi, że Kleopatra uważała się za niegodną jego darów, jest jednak pewien jego powodzenia w miłości. Spotkanie Cezara z ukochaną opóźnia pojawienie się Septymiusza z pochwyconą podczas ucieczki Kornelią. Kornelia uznaje się za więźnia zwycięzcy swego męża i cieszy się, że nie wpadła w ręce jego mordercy. Cezar, który po bitwie pod Farsalos pragnął pojednania z Pompejuszem i przebaczył mu, otacza jego żonę opieką.
Akt IV mały|Przerażenie Cezara na widok głowy Pompejusza. L-F-J. Lagrenée. 1767. Septymiusz przechodzi na służbę Cezara.