Fotyn radzi w tej sytuacji Ptolemeuszowi, by nie polegał na łasce Cezara, lecz sprowadził nocą stacjonujący pod Aleksandrią 6-tysięczny oddział wojska egipskiego, a jednocześnie przy pomocy Germanów z armii Pompejusza niechętnych Cezarowi posłał skrytobójców przeciw swemu wrogowi. Kleopatra powiadamia brata, że Cezar okazał mu łaskę i zachowa go na tronie egipskim. Ptolemeusz prosi siostrę, by wstawiła się za jego doradcami, których Cezar chce stanowczo osądzić i stracić. Cezar ofiaruje Kleopatrze tron Egiptu i współrządy z bratem. Kleopatra wstawia się za Fotynem i Achillasem, kiedy zjawia się Kornelia z wiadomością o przygotowanym na Cezara spisku. Wprawdzie życzy mu śmierci, ale nie z rąk zabójcy jej męża.
Akt V Filip przynosi Kornelii urnę z prochami jej męża i przekazuje wiadomość, że Cezar, zgodnie z obietnicą stracił Fotyna. Kleopatra składa Kornelii kondolencje. Wdowa po Pompejuszu uświadamia jej jednak, że ich oczekiwania są odmienne. Podczas gdy Kornelia pragnie ukarania wszystkich winnych morderstwa jej męża, Kleopatra chciałaby zachować życie brata. Achoreusz przynosi wieści o zamieszkach, do jakich doszło w mieście i o bitwie morskiej pomiędzy Cezarem i Ptolemeuszem, zwycięskiej dla Cezara, podczas której zginął z rąk rzymskich, broniący Ptolemeusza, Achillas.