Do klasztoru często przybywali mieszkańcy Chocimia, Dębowca i Wieszczyny, którzy nie mieli własnego kościoła.

II wojna światowa mały|upright|Pamiątkowy krzyż w miejscu sanktuarium W czasie walk o Prudnik wiosną 1945 roku na Kaplicznej Górze przed żołnierzami Armii Czerwonej bronił się Wehrmacht, oddziały Volksstrumu, Hitlerjugend i żandarmeria. Sanktuarium zostało częściowo zniszczone przez ostrzały artyleryjskie. W okresie PRL-u większość pozostałości zabudowań na Kaplicznej Górze zniszczono. Jeszcze na początku lat 90. stała tu ostatnia kapliczka, którą potem przewrócono. W ostatnich latach XX wieku na Kapliczną Górę zwieziono gruz i ziemię, zasypując fragmenty ruin klasztoru. Z inicjatywy dominikanina Edwarda Olecha oraz ks. Zygmunta Nabzdyka, w 1992 szczycie Kaplicznej Góry postawiono pamiątkowy krzyż z tablicą przedstawiającą historię sanktuarium.

Obraz Matki Boskiej Nieustającej Pomocy z sanktuarium na Kaplicznej Górze znajduje się w klasztorze franciszkanów w Dusznikach-Zdroju.