Wśród allochtonicznego materiału frakcji żwirowej dominują fragmenty skał krystalicznych, budujących górne piętro doliny Zimnej Wody Orawskiej.
Szata naciekowa jaskini jest stosunkowo skromna i reprezentowana głównie przez polewy naciekowe. Powstawały one w pięciu etapach, poczynając od ok. 200 tys. lat temu.
Mikroklimat Jaskinia charakteryzuje się statycznym mikroklimatem. Temperatura wewnątrz waha się pomiędzy 4,9 a 5,5 °C.
Historia poznania i eksploatacji Wstępne, tak zwane „suche partie” jaskini, a także jej system hydrologiczny z sąsiednim Wypływem Stefkowskiego Potoku były od dawna znane okolicznym mieszkańcom. Gdy przez Zuberec płynęło zbyt mało wody, mieszkańcy regulowali tok Zimnej Wody Orawskiej tak, by przepuścić go przez jaskinię i uzupełnić wodę w potokach Suchym i Stefkowskim.
Już w XIX w. partie wstępne zwiedzali tatrzańscy turyści, między innymi Tytus Chałubiński (w 1886 r.) i Jan Gwalbert Pawlikowski (przed 1887 r.). Znana długość jaskini wynosiła wtedy ponad 450 m.