Ostatecznie zwierzęta domowe były przetrzymywane w domach lub umieszczane w klatkach, podczas gdy bezpańskie zwierzęta zaczęto zabijać, aby zapobiec dalszemu rozprzestrzenianiu się choroby. Wiele osób ukrywało skażone towary, aby władze ich nie zniszczyły.
19 czerwca w Valletcie, Florianie i Three Cities założono w różnych miejscach balustrady, rozmieszczone w taki sposób, że pozwalały ludziom po przeciwnych stronach rozmawiać bez wchodzenia ze sobą w kontakt. Zrobiono to w celu zapewnienia dostaw żywności ze wsi do miast. Valletta została podzielona na osiem dzielnic, a przemieszczanie się ludzi zostało ograniczone pod groźbą kary śmierci. Podobne ograniczenia zostały również nałożone na Three Cities. Oakes utworzył Korpus Strażników Obywatelskich, aby obserwować domy zarażonych i egzekwować przepisy, a także mianował na tymczasowe stanowisko Generalnego Inspektora, mającego władzę nad Strażą Obywatelską i policją. Sklepy sprzedające żywność mogły być otwarte tylko przez cztery godziny dziennie.