Zgodnie z rozkazem NDW nr 3 z 29 marca, głównym zadaniem Ministerstwa Spraw Wojskowych było „zajmowanie się wszelkimi sprawami, które dotyczą kwestii formowania armii i prowadzenia tych formowań, nadzór nad nimi i odpowiedzialność za nie", a rozkaz Ministerstwa Spraw Wojskowych nr 14 z 31 marca wprowadzał nowe etaty resortu i instrukcję o podziale kompetencji pomiędzy różnymi komórkami.

9 maja rozpoczęto przeniesienie ministerstwa z Kamieńca Podolskiego do Winnicy. Jednak wskutek przełamania frontu przez Armię Budionnego resort wojskowy URL został 9 czerwca ewakuowany do Żmerynki, 16 czerwca − do Starokonstantynowa, a 24 czerwca przez Płoskirów z powrotem trafił do Kamieńca Podolskiego, gdzie „przystąpił do normalnej pracy”. Z uwagi na zmieniającą się sytuację na froncie, ewakuacja trwała jednak nadal. 9 lipca rozpoczęto ewakuację przez Zaleszczyki do Stanisławowa, a 15 lipca dalej do Rzeszowa.