Jana Chryzostoma w Nowogrodzie Wielkim, a w miejsce drewnianej cerkwi Objawienia Pańskiego wzniósł cerkiew nadbramną na terenie rezydencji metropolity.

Udział w sądzie nad patriarchą Nikonem Pitirim brał udział w przygotowaniach do soboru, który w zamiarze Aleksego I miał ostatecznie potępić Nikona i przeprowadzić wybory nowego patriarchy. Być może brał udział w przygotowywaniu dokumentów soborowych i mów, jakie przedstawiciele Rosyjskiego Kościoła Prawosławnego wygłosili do cara i do obecnych na miejscu hierarchów z patriarchatów starożytnych. Razem z księciem Aleksiejem Trubieckim zaświadczał, że patriarcha, zapowiadając swoje odejście z urzędu, stwierdził, że będzie przeklęty, jeśli zapragnie wrócić do jego sprawowania. Świadectwo Pitirima miało zasadnicze znaczenie w przygotowywanym procesie Nikona, ponieważ gdyby udowodniono mu wypowiedzenie tej formuły, jego powrót na tron patriarszy w ogóle nie byłby możliwy. Inni świadkowie wystąpienia patriarchy (arcybiskup twerski Joazaf, biskup Serbskiego Kościoła Prawosławnego Gabriel, kilku przełożonych monasterów moskiewskich) nie potwierdzili słów metropolity nowogrodzkiego.

W 1666 r., na soborze z udziałem hierarchów starożytnych patriarchatów prawosławnych, ostro krytykował Nikona, mszcząc się za wcześniejszą ekskomunikę.