Ostatecznie Tunel Krakowskiego Szybkiego Tramwaju został uroczyście otwarty 11 grudnia 2008, po 34 latach budowy. W dniu otwarcia na specjalnej, darmowej linii 90 kursowały tramwaje przez tunel z pętli Wieczysta do pętli Dworzec Towarowy. Następnego dnia przystanek został oddany do użytku dla pierwszej linii Krakowskiego Szybkiego Tramwaju z numerem 50.
Infrastruktura Tunel Krakowskiego Szybkiego Tramwaju był uznawany za najdłuższy (przynajmniej do 2020) i najgłębszy tunel tramwajowy (przynajmniej do 2010). Przystanek Dworzec Główny Tunel znajduje się na głębokości 12 metrów pod ziemią. Jest to jednocześnie najniższy poziom na terenie całego obiektu.
Infrastruktura przystanku została dostosowana do potrzeb osób o ograniczonej mobilności, co zapewniono poprzez montaż wind, schodów ruchomych oraz pochylni. Ponadto, z myślą o osobach niesłyszących zainstalowano systemy alarmowe typu SOS. Niektóre ze schodów ruchomych, znajdujących się na terenie przystanku, są jednymi z najdłuższych w kraju.