Produkcja Luftwaffe zamówiła 20 samolotów, a dalsze 10 egz. dla linii lotniczych Lufthansa. Produkcja seryjna została uruchomiona w zakładach SNCASE w Tuluzie. Jednak sabotaże przeprowadzane przez francuskich robotników w zakładach powodowały opóźnienie produkcji, ostatecznie lotnictwo RAF wykonało kilkakrotnie naloty bombowe na zakłady w Tuluzie, 10 marca 1944 oraz 5 kwietnia, wskutek czego do końca wojny nie dostarczono ani jednego egzemplarza samolotu. Po zakończeniu wojny francuskie linie lotnicze Air France chciały zakupić samoloty Douglas DC-4, które były znacznie nowocześniejsze od krajowego SNCASE SE-161, jednak francuskie Ministerstwo Lotnictwa postanowiło ostatecznie zamówić 125 egzemplarzy francuskich samolotów SE-161, w tym 40 egz. dla Air France. Wznowiono produkcję zmodyfikowanej wersji o oznaczeniu SNCASE SE-161 „Languedoc”. Pierwszy egzemplarz seryjny samolotu SE-161.1 „Languedoc” wystartował 17 września 1945 roku. Samolot wyposażono w mocniejsze silniki w porównaniu do prototypu (francuskie Gnôme-Rhône 14N-54/55 o mocy 846 kW każdy).