Koordynował współpracę pomiędzy Oddziałem NASA a australijskim ministerstwem ds. nauki i techniki (Department of Science and Technology). Wspomniane obowiązki uniemożliwiły mu ponowny lot w kosmos w ramach misji STS-41-C. 1984-1987 – w Johnson Space Center był dyrektorem Wydziału Badań Kosmicznych i Medyczno-biologicznych. marzec 1987 – opuścił korpus astronautów NASA.
Loty załogowe Skylab 2 thumb|Joseph Kerwin podczas przygotowań przedstartowych thumb|Astronauci Weitz i Kerwin podczas eksperymentu medycznego 25 maja 1973 wystartował na pokładzie statku Apollo do misji oznaczonej jako Skylab SL-2. Była to pierwsza załogowa misja, jaka udała się na pokład amerykańskiej stacji kosmicznej Skylab, wystrzelonej na orbitę okołoziemską przy użyciu zmodyfikowanej rakiety nośnej Saturn V (bez trzeciego stopnia) 14 maja 1973. Dowódcą wyprawy był Charles Conrad, a pilotem misji Paul Weitz. Joseph Kerwin pełnił funkcję pilota-naukowca.