Nazwa podrodzaju pochodzi od słowa panya-en z języka Pala'wan. Słowo to zostało użyte przez lokalnego mieszkańca Palawanu do opisania żółwi w badaniu z 2003 roku. Słowo to oznacza „zaczarowany”, prawdopodobnie dlatego, że żółwie te były ulubionymi zwierzętami duchów lasu. -emys pochodzi od greckiego słowa εμύς, oznaczającego „żółw słodkowodny”.
Nazwa rodzajowa została ustanowiona na cześć austriackiego zoologa Friedricha Siebenrocka. Podczas gdy nazwa gatunkowa oznacza „z (wyspy) Leyte”. Jest to nazwa błędna, ponieważ żółw w rzeczywistości pochodzi Palawanu i okolicznych wysp i nie występuje na Leyte.
Historia odkrycia Gatunek został po raz pierwszy opisany przez amerykańskiego herpetologa Edwarda Harrisona Taylora w 1920 roku jako Heosemys leytensi. Autor opisał go na podstawie dwóch okazów (samca i samicy) zebranych przez Gregorio Lopeza, rzekomo z bagien gminy Cabalian w południowej Leyte (obecnie znanej jako gmina San Juan). Okazy te zostały niestety zniszczone podczas II wojny światowej podczas bombardowania Manili.