Od 1 września 1958 służył jako psycholog wojskowy w siłach zbrojnych Republiki Federalnej Niemiec (Bundeswehrze) w Kolonii i Monachium, a od lutego 1959 roku w Federalnym Ministerstwie Obrony w Bonn, jako konsultant pomocniczy w Departamencie Psychologii Wojskowej i zastępca Głównego Psychologa Wojskowego. W 1959 roku został mianowany starszym radcą rządowym (Oberregierungsrat), w 1963 roku dyrektorem rządowym, a w 1968 starszym dyrektorem rządowym. Willy Lindstaedt był odpowiedzialny za ocenę zdolności i przydatności poborowych; pracował również w niepełnym wymiarze godzin w poradnictwie małżeńskim i rodzinnym. Pod koniec 1968 roku przeszedł z czynnej służby na własną prośbę na emeryturę. W 1976 roku otworzył prywatną praktykę psychologiczną, oferującą poradnictwo życiowe i rodzinne. Zmarł 21 stycznia 1991 roku w Mosbach w Badenii.
W 1969 otrzymał Order Zasługi Republiki Federalnej Niemiec – Krzyż Zasługi 1. Klasy (Bundesverdienstkreuz 1. Klasse). Prace naukowe Lindstaedta znajdują się w Archiwum Badań nad Historią Psychologii w Uniwersytet Kształcenia na Odległość w Hagen (FernUniversität in Hagen).