w latach 2005–2008 pełnił funkcję wiceprzewodniczącego Komisji Badań na Rzecz Gospodarki, a w kadencji 2008–2011 był członkiem Komisji Badań na Rzecz Rozwoju Nauki. W okresie 2005–2009 przewodniczył Zespołowi Badań na Rzecz Obronności i Bezpieczeństwa przy Ministrze Nauki i Szkolnictwa Wyższego.
Nagrody i wyróżnienia Profesor Wojciech Przetakiewicz został uhonorowany wpisem do „Złotej Księgi Dokonań Wojskowej Akademii Technicznej” w 2006 roku, a w 2009 roku nadano mu tytuł Honorowego Profesora Wydziału Nowych Technologii i Chemii WAT. Jego aktywność naukowa oraz zaangażowanie organizacyjne były doceniane licznymi nagrodami, w tym Indywidualną Nagrodą Sekretarza Wydziału IV Nauk Technicznych Polskiej Akademii Nauk (1980), Nagrodą I stopnia Szefa Sztabu Generalnego Wojska Polskiego za najlepszą rozprawę habilitacyjną roku (1986), a także około dwudziestoma nagrodami Rektora Wojskowej Akademii Technicznej oraz Rektora Akademii Morskiej w Szczecinie. Wśród licznych odznaczeń państwowych, resortowych i środowiskowych przyznanych profesorowi Wojciechowi Przetakiewiczowi znalazły się m.in.: