Dodatkowo dekret „O rozdziale Kościoła od państwa i szkoły od Kościoła” określił relację między szkołą a Kościołem. „Szkoła zostaje oddzielona od Kościoła” – głosił dekret. „Nauczanie doktryn religijnych we wszystkich państwowych i publicznych, a także prywatnych instytucjach edukacyjnych, w których wykładane są przedmioty ogólne, jest niedozwolone. Obywatele mogą nauczać i uczyć się religii prywatnie”.
Patriarcha Moskwy Tichon rzucił klątwę na przywódców radzieckich 19 stycznia 1918 roku (według kalendarza juliańskiego) za prowadzenie tej kampanii. W odwecie reżim aresztował i zabił dziesiątki biskupów, tysiące duchownych niższego szczebla i mnichów oraz rzesze świeckich. Przejmowanie majątku kościelnego w ciągu następnych kilku lat było naznaczone brutalną kampanią gwałtownego terroru.
Podczas rosyjskiej wojny domowej zginęło wielu duchownych. Niektórzy padli ofiarą spontanicznej przemocy, powszechnej w próżni władzy czasu wojny, a inni zostali rozstrzelani przez służby bezpieczeństwa państwowego za wspieranie Białych Armii. Kościół twierdził, że podczas rewolucji zabito 322 biskupów i księży.