W 2010 roku Committee for Skeptical Inquiry wybrał go do grona swoich członków (), obok innych osób popularyzujących naukowe podejście do nadzwyczajnych twierdzeń.

W wywiadach podkreślał, że sceptycyzm rozumie nie jako prostą negację, lecz jako postawę obejmującą wymaganie dowodów, gotowość do zmiany zdania oraz ostrożność wobec własnych intuicji. Wskazywał przy tym, że działalność sceptyczna nie była dla niego dochodowym zajęciem; motywowały go przede wszystkim reakcje czytelników, praca dydaktyczna i kontakt ze środowiskiem osób zainteresowanych krytycznym myśleniem.

Spory i polemiki Polemiczny charakter The Skeptic's Dictionary prowadził do sporów z autorami, których poglądy Carroll krytykował. Po opublikowaniu artykułu, w którym zaliczył teksty o „alternatywnej nauce” do kategorii „internetowych bzdur” (), Milton odpowiedział, zarzucając Carrollowi „pseudosceptycyzm”, fabrykowanie cytatów i zniekształcanie jego argumentów.