2024 622 200 1700 250.
Modernizacja thumb|left|Perony przed modernizacją (2015) thumb|LCS Małkinia thumb|Peron nr 1 po modernizacji (2019) 13 czerwca 2017 PKP Polskie Linie Kolejowe podpisały umowę na modernizację odcinka linii kolejowej nr 6 Sadowne – Czyżew prowadzonej w ramach projektu Rail Baltica wraz z budową lokalnego centrum sterowania w Małkini. W sierpniu 2017 zamknięto tor nr 1 (w kierunku Białegostoku) i przystąpiono do rozbiórki peronu 1. Jednym z warunków prac było pozostawienie możliwości mijania się pociągów w Małkini, dlatego podczas pierwszej fazy modernizacji czynny był peron 2 i jego obydwie krawędzie. Nowy peron 1 ma już dwie krawędzie i został oddany do użytku 10 marca 2019 r. Wówczas zaczęły się prace przy peronie 2 i przyległych mu torach. Do użytku pasażerów jest budowane przejście podziemne na perony wraz z pochylniami.