Twórczość Dwanaście książek „popularnonaukowych” (Castaneda pisał też prace akademickie) jest zorganizowanych w trzy zbiory po cztery, każdy zbiór odpowiada tolteckim sztukom: sztuce wojownika, sztuce podchodzenia oraz sztuce intencji. Dla każdej ze sztuk istnieje również kompendium, które opisuje najistotniejsze ze wszystkich nauk danej serii. Trzy kompendia w ramach tych zbiorów zostały opublikowane pośmiertnie.
Sztuka wojownika: Nauki Don Juana (1968) Odrębna rzeczywistość (1971) Podróż do Ixtlan (1972) Kompendium: Magiczne Kroki (1998)
Sztuka podchodzenia: Opowieści o mocy (1974) Drugi krąg mocy (1977) Dar orła (1981) Aktywna strona nieskończoności (1999)
Sztuka intencji: Wewnętrzny ogień (1984) Potęga milczenia (1987) Sztuka śnienia (1993) Kompendium: Koło Czasu (2000)