Nadużycia i nadzór W latach 70. XX wieku ujawniono liczne nadużycia agencji. CIA dostarczyła sprzęt „hydraulikom” z otoczenia Richarda Nixona zamieszanym w aferę Watergate, a w 1974 roku prasa opisała prowadzoną przez nią nielegalną inwigilację, w tym operację „Chaos” wymierzoną w amerykański ruch antywojenny oraz program kontroli umysłu MKUltra z użyciem LSD. Ujawniono też udział agencji w planach zabójstw zagranicznych przywódców. Doprowadziło to w połowie lat 70. do śledztw senackiej komisji Churcha oraz prezydenckiej komisji Rockefellera.
Lata 80. Za dyrekcji Williama Caseya, mianowanego przez prezydenta Ronalda Reagana, CIA prowadziła operację Cyclone – jedną z najdłuższych i najkosztowniejszych tajnych akcji w swojej historii, polegającą na wspieraniu afgańskich mudżahedinów w czasie radzieckiej interwencji w Afganistanie (1979–1989), w dużej mierze za pośrednictwem pakistańskiego wywiadu ISI. W 1985 roku oficer kontrwywiadu CIA Aldrich Ames rozpoczął współpracę z KGB, któremu wydał kilkudziesięciu agentów pracujących dla Zachodu (część stracono), rozbijając siatkę agencji w ZSRR. Amesa zdemaskowano i aresztowano dopiero w 1994 roku.