minucie wyprowadził Bayern na 1:2, a następnie strzelił bramkę z woleja.
W dniu 4 lutego 2010 roku Bayern Monachium ogłosił, że Van Buyten podpisał nowy kontrakt, na którego mocy zostanie w klubie do 2012 roku. W drugiej połowie sezonu 2010-11 Van Buyten spadł głównie na ławkę rezerwowych, ale odzyskał miejsce w składzie pod koniec sezonu. Był obecny od początku meczu z FC St. Pauli 11 maja 2011 r., strzelając gola w zwycięstwie 8:1, które skazało drużynę z Hamburga na spadek do 2. Bundesligi.
17 grudnia 2011 roku w meczu Bayern Monachium z FC Köln Van Buyten uderzył z rzutu wolnego tak mocno, że piłka pękła. W dniu 30 kwietnia 2012 roku Van Buyten podpisał roczną umowę przedłużającą jego pobyt w Monachium.
Pomimo przybycia środkowego obrońcy Dantego z Borussii Mönchengladbach latem 2012 r. Van Buyten stał się integralnym członkiem zaplecza Bawarczyków podczas kampanii 2012–2013, co było częścią trzyosobowej rotacji w centrum obrony z Dante i Jérôme Boateng. 6 kwietnia 2013 roku, po porażce 1:0 z Eintrachtem Frankfurt dzięki bramce Bastiana Schweinsteigera, Van Buyten świętował swoje trzecie mistrzostwo Bundesligi z Bayernem, zdobywając 23. tytuł mistrzowskiego klubu. Van Buyten rozegrał pełne 90 minut w wygranym 3:0 rewanżowym meczu półfinałowym z mistrzem Hiszpanii – Barceloną.