Komitety mają charakter ogólny, branżowy lub regionalny. Wykaz aktualnie pracujących ciał pomocniczych Komisji Kodeksu Żywnościowego.
Komitety ogólne
Komitet do spraw Zasad Ogólnych () Komitet do spraw Substancji Dodatkowych do Żywności () Komitet do spraw Zanieczyszczeń Żywności () Komitet do spraw Higieny Żywności () Komitet do spraw Znakowania Żywności () Komitet do spraw Kontroli Żywności w Imporcie i Eksporcie oraz Systemów Certyfikacji () Komitet do spraw Pozostałości Pestycydów () Komitet do spraw Pozostałości Leków Weterynaryjnych w Żywności () Komitet do spraw Metod Analiz i Próbkobrania () Komitet do spraw Żywienia oraz Żywności Przeznaczonej do Specjalnych Celów Żywieniowych ()
Komitety branżowe
Komitet do spraw Świeżych Owoców i Warzyw () Komitet do spraw Ryb i Produktów Rybnych () Komitet do spraw Przypraw i Ziół Kulinarnych () Komitet do spraw Tłuszczów i Olejów ()
Komitety Regionalne
Komitet Regionalny dla Afryki () Komitet Regionalny dla Azji () Komitet Regionalny dla Europy () Komitet Regionalny dla Ameryki Łacińskiej i Karaibów () Komitet Regionalny dla Ameryki Północnej i Południowo-Zachodniego Pacyfiku () Komitet Regionalny dla Bliskiego Wschodu ()