Druga generacja Expedition zastąpiła produkowany dotychczas model po 6 latach rynkowej obecności, powstając od podstaw jako zupełnie nowa konstrukcja. Samochód zyskał nowocześniejszy projekt stylistyczny z bardziej masywnym nadwoziem, wyróżniając się m.in. mniejszą ilością chromu na rzecz obszerniejszej atrapy chłodnicy o strukturze kraty, a także charakterystyczną, wydłużoną częścią transportową.
Dzięki obszernym modyfikacjom technicznym na czele z wykorzystaniem nowej płyty podłogowej, Ford Expedition drugiej generacji zyskał obszerniejsze wnętrze mogące pomieścić maksymalnie 8 pasażerów, z czego gdy trzeci rząd siedzeń znajdujący się w bagażniku nie był wykorzystywany można było go schować elektrycznie. Ponadto, samochód mógł tym razem ciągnąć przyczepy o większej masie całkowitej wynoszącej 4037 kilogramów.
Innymi charakterystycznymi, jakie wzbogaciły elementy wyposażenia Expedition drugiej generacji, były także kierunkowskazy wbudowane w lusterka boczne, a także opcjonalne dwubarwne malowanie nadwozia oraz tylna szyba, która może otwierać się niezależnie od klapy bagażnika.