Twórczość naukowa i literacka Na dorobek naukowy Sikory składa się ponad 300 publikacji, w tym monografie naukowe, antologie tekstów pod jego redakcją, książki popularnonaukowe z obszernymi wyborami tekstów prezentowanych autorów, artykuły w książkach zbiorowych i w czasopismach naukowych oraz książki o charakterze podręcznikowym, popularyzujące filozofię, między innymi „Siedmiu greckich filozofów” (1976), „Filozofowie XVII wieku” (1978), „Spotkania z filozofią” (pierwodruk: 1965, a potem siedem ciągle poszerzanych wydań do 1995 roku), w późniejszej wersji wzbogacone i zmienione pod tytułem „Od Heraklita do Husserla” (kolejne wydania: 1999, 2005, 2009). Nakłady wydań tej ostatniej pozycji przekroczyły 300 tys. egzemplarzy, dzięki czemu ich autora uznać można za nauczyciela całego pokolenia zainteresowanych rozumieniem filozofii czytelników.
Główne obszary badań naukowych Sikory to myśl społeczna i religijna epoki romantyzmu oraz utopijne programy społeczno-polityczne rozkwitające we Francji i w Polsce na przełomie XVIII i XIX wieku.