Próbując ponownie umocnić niemiecką władzę, Wyższy Dowódca SS i Policji w Protektoracie Karl Hermann Frank nadał przez radio wiadomość, w której groził zniszczeniem Pragi i utopieniem we krwi wszelkiej opozycji.
Na początku 1945 roku byli oficerowie Wojska Czechosłowacji utworzyli dowództwo „Bartoš” kierowane przez generała w celu nadzorowania walk w Pradze oraz dowództwo „Alex” kierowane przez generała Františka Slunečkę w celu kierowania oddziałami powstańczymi na przedmieściach Pragi. W międzyczasie utworzono Czeską Radę Narodową, składającą się z przedstawicieli różnych czeskich partii politycznych, która miała przejąć przywództwo polityczne po obaleniu nazistowskiego rządu okupacyjnego i czeskich władz kolaboracyjnych. Przywódcy wojskowi planujący powstanie w Pradze liczyli na lojalność etnicznie czeskich członków policji i żandarmerii oraz Wojska Rządowego Protektoratu Czech i Moraw, a także funkcjonariuszy kluczowych służb cywilnych, takich jak pracownicy transportu i straży pożarnej. 1 Dywizja Piechoty Rosyjskiej Armii Wyzwoleńczej (ROA), złożona z radzieckich jeńców wojennych, którzy zgodzili się walczyć po stronie niemieckiej, stacjonowała poza Pragą.