Rodzina W 1817 roku Konstandinos Kanaris poślubił Despinę Maniatis z historycznej rodziny z Psary. Z małżeństwa tego pochodziło siedmioro dzieci: Nikolaos Kanaris (1818–1848), zginął podczas wyprawy wojskowej w Bejrucie Temistoklis Kanaris (1819–1851), zginął podczas wyprawy wojskowej w Egipcie Trasiwulos Kanaris (1820–1898), admirał Miltiadis Kanaris (1822–1901), admirał, wieloletni członek parlamentu greckiego, trzykrotny minister marynarki w latach 1864, 1871 i 1878 Likurgos Kanaris (1826–1865), oficer i prawnik Maria Kanaris (1828–1847) Aristidis Kanaris (1831–1863), oficer, zginął podczas powstania w Atenach
mały|upright=0.8|Dom Kanarisa w Eretrii
Niemiecki admirał Wilhelm Canaris spekulował, że mógł być potomkiem Konstandinosa Kanarisa. Oficjalne badanie genealogiczne wykonane w 1938 roku wykazało jednak, że miał pochodzenie włoskie i nie stwierdzono jakiegokolwiek pokrewieństwa z Kanarisem, pomimo greckiej formy nazwiska.
Upamiętnienie mały|upright=0.8|Srebrna urna zawierająca serce Kanarisa w Narodowym Muzeum Historycznym w Atenach