Następny wielki pożar miał miejsce 26 maja 1785 roku, który strawił odbudowany po poprzednim pożarze ratusz, a także uszkodził kościół i klasztor Franciszkanów.
thumb|Popiersie Józefa Wybickiego Pod koniec istnienia I Rzeczypospolitej, 6 sierpnia 1791 roku, na rynku w Śremie mieszkający w pobliskich Manieczkach Józef Wybicki, aby móc reprezentować Poznań i Śrem na Sejmie w Warszawie, złożył deklarację przystąpienia do stanu mieszczańskiego, przysięgając słowami: "zwierzchności miasta Srzemu, w którym do obywatelstwa przyłączony jestem, podległym bydź chcę i obowiązki wszalakie zachowam"Zawadzki R. Przechadzki po Śremie rozdział III, Śrem 2004, Dzieje Śremu, red. M. Rezler, ss 65–140.
Od rozbiorów do I wojny światowej thumb|Fragment mapy powiatu Śrem (Landkreis Schrimm) z 1914 r. W 1793 roku według postanowień II rozbioru Polski Śrem został włączony do Prus Południowych. W 1794 roku tenutariusz śremski Józef Niemojewski z polecenia Tadeusza Kościuszki stoczył zwycięskie walki na terenie Wielkopolskich w okolicach Śremu, Czempinia, Czmonia, Rąbinia i Mosiny. Następnie przyłączył się do wojsk generała Jana Dąbrowskiego.