Spadek ilości płytek krwi, a tym samym zaburzenia krzepnięcia przebiegające w postaci plamicy małopłytkowej z towarzyszącą anemią hemolityczną, pociąga za sobą ryzyko wystąpienia krwawień np. do światła przewodu pokarmowego, a także krwotoków (opisano przypadek krwotoku podtwardówkowego). Ze względu na ciężkie powikłania HGA związane często z rozwojem oportunistycznych zakażeń grzybiczych i wirusowych – zapalenie płuc spowodowane przez Candida albicans i Cryptococcus neoformans czy zapalenie i krwotok z górnego odcinka przewodu pokarmowego wywołane infekcją Herpes simplex i C. albicans – a także wcześnie ujawniający się zespół rozsianego wykrzepiania wewnątrznaczyniowego, śmiertelność wśród osób zakażonych sięga do 5%.
W przypadku zakażenia A. phagocytophilum może dochodzić do reinfekcji, natomiast nie wiadomo do końca czy możliwe jest aby HGA przybierała postać przewlekłą.
Rozpoznanie mały|Zdjęcie w mikroskopie świetlnym Anaplasma phagocytophilum hodowanego w ludzkiej linii komórek promielocytowych HL-60, przedstawiające A. phagocytophilum morulae jako wtręty bazofilne i wewnątrzcytoplazmatyczne (strzałki).