Semkowicza, zajęła się również zabezpieczeniem zbiorów uczelniMarcin Starzyński, Nieznane wspomnienie wojenne profesor Zofii Kozłowskiej-Budkowej, Kartka do dziejów Uniwersytetu Jagiellońskiego w latach 1939–1944, „Alma Mater” Miesięcznik Uniwersytetu Jagiellońskiego nr 212 specjalny, 2019, s. 49–53; Załącznik Sprawozdanie docent Zofii Budkowej za lata 1939–1944 oprac. Patrycja Wiencerz, s. 51–52 – wersja elektroniczna.. Po wyzwoleniu w 1945 objęła stanowisko adiunkta, a w 1954 roku – profesora nadzwyczajnego na UJ.
Od 1927 była żoną archiwisty i historyka Włodzimierza Budki (1894-1977), mieli córkę Anielę. Pochowana na cmentarzu Rakowickim w KrakowieKwatera: HA, rząd: 8, miejsce: 4. razem z mężem i córką oraz siostrzenicą Anną Dąbrowską (córką siostry Heleny Kozłowskiej-Dąbrowskiej). Pozostawiła po sobie Wspomnienia z lat 1893–1923, opublikowane w 2018 roku.