W trakcie swojego życia zgromadził księgozbiór liczący ok. 7 tys. pozycji, który spłonął. Zachowały się natomiast zgromadzone przez niego m.in. rękopisy Norwida, notatki i prace dotyczące Hoene-Wrońskiego, a także bogata korespondencja (obecnie zbiory te znajdują się w Bibliotece Narodowej w Warszawie), które zostały wywiezione z Warszawy do Pruszkowa przez ewakuacyjną grupę bibliotekarską w styczniu 1945. 20 grudniu 1946, w 125 rocznicę urodzin Cypriana Norwida, w Muzeum Narodowym w Warszawie została otwarta wystawa poświęconą życiu i twórczości tego wielkiego artysty – zorganizowana przez Wacława Borowego. Stała się ona hołdem dla Zenona Przesmyckiego, którego zebrane materiały stanowiły zasadniczą część zgromadzonych eksponatów. mały|238x238px|Grób Zenona Przesmyckiego na cmentarzu Powązkowskim po renowacji. W 2022 z inicjatywy Premiera RP Mateusza Morawieckiego grób Przesmyckiego został odrestaurowany. Cały projekt był realizowany przez Fundację Stare Powązki, we współpracy z Kancelarią Prezesa Rady Ministrów.
Życie prywatne Miał trzech braci. W 1905 ożenił się z Anielą Hoene (1867–1938), córką sędziego trybunału, właścicielką pensji dla dziewcząt w Warszawie. Dzieci nie mieli, mieszkali w Warszawie przy ul. Mazowieckiej 4.