Nie wystąpił przez to w meczu rewanżowym, wygranym przez krakowski klub 2:1.
2002/2003 Sezon 2002/2003 był dla Wisły udany, krakowianie zdobyli Mistrzostwo Polski oraz dotarli do IV rundy Pucharu UEFA oraz wygrali Puchar Polski. Baszczyński zaliczył 25 występów w Ekstraklasie, strzelił w nich jedną bramkę czterokrotnie był karany żółtą kartką. W Pucharze Polski zagrał 6 razy strzelając jedną bramkę. Natomiast w Pucharze UEFA zagrał we wszystkich 10 meczach krakowskiej Wisły. Więcej występów we wszystkich rozgrywkach zaliczyli Maciej Żurawski, Kamil Kosowski, Arkadiusz Głowacki i Marcin Kuźba.
2003/2004 W pierwszym meczu sezonu 2003/2004 Baszczyński zdobył swoją pierwszą bramkę w europejskich pucharach, w meczu z cypryjską Omonią, który Wisła wygrała 5:2. W 21 kolejce ligowej Baszczyński zdobył bramkę na 2:0 w meczu z Widzewem Łódź, mecz zakończył się wynikiem 3:1 dla Wisły.
W sezonie 2003/2004 Baszczyński po raz trzeci zwyciężył z Wisła rozgrywki Ekstraklasy. Zagrał w 24 meczach ligowych, zdobył jedną bramkę, sędziowie pokazali mu 5 razy żółtą kartkę.