Księga zawierająca manuskrypt miała – zdaniem Jerzego Gaczyńskiego – zaginąć z Archiwum Parafialnego i Dekanalnego parafii św. Józefa przy kościele Narodzenia NMP w Ciechanowie po 1986 r. Jedyną osobą, która naukowo korzystała z oryginału był więc Jerzy Gaczyński. Z rękopisu „Rocznika” Jerzy Gaczyński, jako wydawca sporządził w 1975 r. odpis odręczny lub na maszynie. Poza Jerzym Gaczyńskim fakt istnienia Rocznika potwierdził Aleksander KociszewskiA. Kociszewski, Od castrum do oppidum. Problemy genezy i rozwoju Ciechanowa, „Zapiski Ciechanowskie” 1992, nr 8, s. 20.. Tekst „Rocznika Ciechanowskiego” wraz z krytycznym opisem został w końcu opublikowany w 1995 r. przez Jerzego GaczyńskiegoJ. Gaczyński, Rocznik Ciechanowski, Rola i znaczenie Ciechanowa w dziejach Mazowsza, Ciechanów 1995, s. 41–66.. Jak dodawał Wojciech Górczyk: „Kiedy na przełomie 1983 i 1984 r. J. Gaczyński, dopiero po 8 latach od odkrycia, chciał „rocznik” sfotografować, rękopis znikł i nikt po dziś dzień nie wie, co się z nim stało.”Wojciech Górczyk, Ciechanów – zarys dziejów do XV w., „Kultura i Historia”.