Rozbity 30 czerwca 1943 roku w jednostce szkolnej Flugzeugführerschule C 15 (FFS C 15) w Bourges. Si 204 V10 – prototyp wyposażony w silniki Argus As 410 i przeznaczony do prób w locie. Si 204 V11 – prototyp wyposażony w silniki Argus As 410 i przeznaczony do prób w locie. Si 204 V12 – prototyp wyposażony w silniki Argus As 410 i przeznaczony do prób w locie. Rozbity 13 marca 1944 roku w jednostce doświadczalnej Erprobungs-Stelle Rechlin w Rechlinie. Si 204 V13 – prototyp wyposażony w silniki Argus As 410 i przeznaczony do prób w locie. Si 204 V14 – prototyp wersji D-2, wyposażony w silniki Argus As 411. Si 204 V15 – prototyp przeznaczony do testów silników Argus As 411.
Wersje produkcyjne Si 204A-0 – seria informacyjna wersji samolotu pasażerskiego, budowana przez zakłady SNCAC we Francji między kwietniem 1942 i listopadem 1943 roku. Si 204A-1 – wersja seryjna samolotu pasażerskiego, budowana przez zakłady SNCAN we Francji między kwietniem 1942 i listopadem 1943 roku. Si 204D-0 – seria informacyjna wersji samolotu szkolnego, budowana przez zakłady ČKD/BMM w Protektoracie Czech i Moraw.