Kompleks budynków przy ul. Mokotowskiej został całkowicie zniszczony w czasie powstania warszawskiego w sierpniu 1944. Główny budynek kompleksu został odbudowany w zmienionej formie w 1949 roku, co upamiętnia tablica z piaskowca umieszczona przy wejściu. Tylko lekko uszkodzony został natomiast budynek dydaktyczny przy ul. św. Andrzeja Boboli.

Szkoła wznowiła działalność 18 września 1945 r. w zachowanym budynku przy ul. Boboli. W hali maszyn zamieszkało 50 studentów. W 1947 r. absolwentom szkoły przyznano stopień inżyniera.

Pomimo sprzeciwu władz uczelni, w 1951 r. nastąpiło jej połączenie z Politechniką Warszawską. Oficjalnym uzasadnieniem dla połączenia było przejście Politechniki na dwustopniowość kształcenia i to, że jej studia zawodowe nie różniły się od studiów Szkoły Wawelberga i Rotwanda.

Nazwy od 1895 – Średnia Szkoła Mechaniczno-Techniczna M. Mittego do 1919 – Szkoła Mechaniczno-Techniczna H. Wawelberga i S. Rotwanda 1919–1929 – Państwowa Szkoła Budowy Maszyn i Elektrotechniki im. H. Wawelberga i S. Rotwanda 1929–1939 – Państwowa Wyższa Szkoła Budowy Maszyn i Elektrotechniki im. H. Wawelberga i S. Rotwanda 1940–1944 – Państwowa Szkoła Budowy Maszyn i Państwowa Szkoła Elektryczna (dwuletnie średnie szkoły techniczne) 1945–1951 – Szkoła Inżynierska im.