Lot thumb|left|Start rakiety Atlas do misji Mercury 9 Start nastąpił w środę 15 maja o godz. 13:04 UTC (8:04 czasu miejscowego) z kosmodromu Cape Canaveral Space Force Station na Przylądku Canaveral. Kapsuła kształtem przypominała dzwon o długości oraz szerokości niecałe dwa metry. Przy starcie kabina miała masę (razem z rakietą ratunkową). 29-metrowa rakieta Atlas D uniosła kabinę „Faith-7”. W 6 minut później, po odłączeniu się od rakiety kapsuła weszła na orbitę, której apogeum wynosiło około , perygeum , a kąt nachylenia względem równika – 32,5°. Jedno okrążenie trwało 89 minut. Głównym celem lotu Coopera było uzyskanie dalszych informacji o wpływie długotrwałej nieważkości na organizm ludzki. W czasie pierwszego okrążenia Cooper przeprowadził rozmowy z Schirrą, Grissomem i Shepardem, ponadto narzekał na szwankujący wymiennik ciepła w skafandrze, który powodował konieczność ręcznej regulacji co 10–15 minut. W trakcie trzeciego okrążenia, gdy kapsuła znajdowała się nad południową częścią Atlantyku, astronauta miał wypuścić plastikowy balon o średnicy 5,75 cala, wyposażony w urządzenie, które przez 10 godzin miało nadawać co sekundę sygnały świetlne widoczne z odległości około .