W czasie II wojny światowej od sierpnia 1940 r. do wiosny 1942 r. była zatrudniona przez niemiecką Abteilung Wissenschaft und Unterricht (okupacyjne władze oświatowe dystryktu krakowskiego, które zarządzały m.in. muzeami) do pomocy przy zbiorach botanicznych Muzeum Fizjograficznego PAU.
Główne osiągnięcia naukowe Zakres badań botanicznych Ireny Dąbkowskiej to florystyka, paleobotanika i palinologia, fitogeografia, torfoznawstwo. Florystyka. Opublikowała dane o nowym stanowisku kotewki mucańskiej (Trapa muzzanensis Jäggi) z jeziora Pohost w powiecie pińskim. Podała na podstawie literatury i własnych badań stanowiska występowania na Polesiu 16 gatunków z rodziny Juncaceae, 66 gatunków z rodziny Cyperaceae, w tym 2 podane po raz pierwszy dla wschodniej Polski (Carex arenaria L., C. ligerica J. Gay), 79 gatunków z rodziny Gramineae, 22 z rodziny Orchidaceae, 4 z rodziny Sparganiaceae oraz po 2 z rodzin Typhaceae i Araceae. Opisała trzy nowe stanowiska brzozy karłowatej (Betula nana L.) w powiecie święciańskim na Wileńszczyźnie. Paleobotanika.