Wobec niepowodzeń w najwyższej klasie rozgrywkowej, w styczniu 2007 Bueno został trenerem drugoligowego Club León, który pod jego wodzą został czołową drużyną rozgrywek. W wiosennym sezonie Clausura 2007 dotarł z nim do finału drugiej ligi meksykańskiej, natomiast rok później, podczas rozgrywek Clausura 2008 triumfował z Leónem w Primera División A. Sukces ten nie zaowocował jednak awansem do pierwszej ligi wobec porażki w decydującym o promocji dwumeczu z Indios. W marcu 2009 powrócił do pierwszej ligi meksykańskiej, po raz drugi obejmując Club Santos Laguna, który prowadził bez większych osiągnięć do końca roku. W połowie 2010 roku podpisał umowę z drugoligowym klubem Tiburones Rojos de Veracruz, z którego został zwolniony już po dziewięciu ligowych kolejkach, jednak przygotowana przez niego do sezonu Apertura 2010 drużyna, prowadzona już przez Carlosa Turrubiatesa, dotarła do finału Liga de Ascenso. W lutym 2011 zastąpił Daniela Brailovsky'ego na posadzie trenera pierwszoligowego beniaminka – Club Necaxa z siedzibą w mieście Aguascalientes. Nie zdołał odmienić jednak słabej gry ekipy i na koniec rozgrywek 2010/2011 spadł z nią z powrotem do drugiej ligi.